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助力科研 | 互动派王牌课程 AMBER 专题培训班圆满结课

时间:2023-03-23 14:40 点击次数:
2023 年 3 月 19 日,北京国际软研信息技术研究院联合互动派(北京)教育举办的为期 4 天的“AMBER 分子动力学能量优化与分析、结合自由能计算”专题线上培训班顺利结束。

来自复旦大学、南开大学、浙江大学等多所高校学生以及多家研究院如山东省中医药研究院、上海药物研究所等医药研发人员参与了线上课程,北京软研为参与培训并通过考试的学员们颁发《计算机辅助药物设计应用工程师》专业技能结业证书。

本次培训严格遵守“理论+实操+案例”三位一体的原则,在老师的引领下,采用“ 2+2 ”的教学体系,分两阶段(3 月 11 日 - 3 月 12 日、3 月 18 日-3 月 19 日)授课。通过 4天的线上学习,学员们收获颇丰。
 
一、理论优先 夯实基础
老师从最基本的 AMBER 软件安装开始讲起,帮助同学们快速入门,且讲解条理清晰,逻辑分明,内容更是纲举目张,层层递进。不仅深入解读了分子动力学的理论基础,还带领学员熟悉计算机语言,逐步掌握了 LINUX 基础命令,能够使用 vim 编辑器简单编辑文件。

二、实操进阶 知行合一
每一步理论讲解后都会附相应的实操案例,由老师带领学员一步步完成理论复现,真正做到理论联系实践,“沉浸式”学习如何确立研究对象并对其建模,从能量角度出发,分析分子间、残基间、重要基团间相互作用机理,对实验提供理论指导。
学员还通过学习模型预处理流程及输入文件的编写,最终能够独立完成体系动力学之前的准备工作。对初学者来说,老师引导其深入理解自身研究方向,通过对经典文献的复现,学会在复现过程中用到的重要分析手段,并将其融入学员自身的科研工作中,助力顶刊,成功发文!

三、群内答疑 在线互动
老师讲课过程中,有跟不上的部分,可直接在答疑群里提出或与老师连麦,老师会不定时留出答疑时间解决学员的问题,让每一位学员都能跟上老师的节奏。另外,老师在课后会将课程中用到的 PPT 及相关代码案例,电子资料等打包好发在群内方便学员系统学习。以下附四张交流群答疑截图:

                  
 
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